相关性热图-BioLadder云平台（十四）相关性热图是一种将规则化矩阵数据转换成颜色色调的可视化方法，用于展示变量之间的相关性。在BioLadder生物信息在线可视化云平台上，可以轻松绘制和解读相关性热图。以下是详细的步骤和解读：一、什么是相关性热图相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，衡量它们之间的相关密切程度。当两个变量之间存在强烈的相互依赖关系时，我们称之为高度相关性。正相关表示两个变量的值一起增大，负相关则表示一个变量的值增大时，另一个变量的值减小。皮尔逊相关系数是常用的度量两个变量之间相关程度的指标，其值介于-1与1之间。二、绘图前的数据准备在绘制相关性热图前，需要准备包含两个维度数据的文件，通常每一行代表一个基因，每一列代表一个样本。示例数据可以从BioLadder云平台提供的链接下载：https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/Cor/demo.txt。三、BioLadder云平台在线绘制相关性热图上传文件访问BioLadder云平台的相关性热图绘制页面：https://www.bioladder.cn/web/#/chart/3。点击页面上的“选择”按钮上传自己的数据文件。支持txt、csv、xlsx、xls四种格式。上传后，可以在左下方的数据展现区查看自己的数据。调整参数根据需求调整相关参数：对数处理：对数据进行对数转换，选择对数的底数。计算相关性的方法：默认使用皮尔逊算法，还支持spearman、kendall算法。行聚类、列聚类：是否对行或列进行聚类，默认是。显示行名称、列名称：是否显示行名或列名，默认显示。注释图例：是否显示图例，默认显示。颜色：选择热图的颜色，默认为蓝、白、红。提交查看上传完数据并调整好参数后，点击右上方的“提交”按钮，图像会出现在左侧。如果没有上传自己的数据，会使用默认的demo数据绘图。下载选择想要的图片格式（png、jpg、pdf），调整图片的宽、高和分辨率，然后点击“Download”下载按钮。四、相关性热图结果解读相关性热图中的每个小方格表示每个样本之间的相关系数，颜色表示相关性大小。相关性越大，颜色越深。聚类树形图表示对来自不同实验分组的不同样品的聚类分析结果。如果不聚类，排序将保持文件数据的默认方式。五、BioLadder生物信息在线分析可视化云平台BioLadder云平台提供了生物学分析最常用的50多个模块，包括数据可视化、组学数据分析、功能分析和数据预处理等。用户可以根据自己的需求选择合适的模块进行分析。通过BioLadder云平台，用户可以轻松绘制和解读相关性热图，为组学研究提供有力的可视化支持。